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质量其中生物过程条目1 648个

时间: 2025-07-25 13:08:56     来源: zenaxis.fastseoul.com     作者: 时尚先锋

  

2.1.3 GO分类富集分析

将所得到的茵陈预测81个靶点导入STRING数据库进行GO功能富集分析,得到GO条目1 892个,质量其中生物过程条目1 648个,标志细胞组成条目82个,茵陈预测分子功能条目162个,质量分别占73%、标志13%、茵陈预测14%.其中,质量生物过程主要涉及氮化合物代谢过程的标志正调控、大分子代谢过程的茵陈预测正调控、细胞过程的质量正调控、刺激反应的标志调节、细胞对有机物质的茵陈预测反应、细胞对化学刺激的质量反应及对含氧化合物的反应等过程;分子功能主要涉及激活转录因子结合、蛋白质结合、标志酶结合及蛋白质异构化活性等功能;细胞组成涉及在膜结合细胞器、细胞质部、胞外区及细胞器等区域.3个分支数量排名前20位相关条目信息柱状图如图2所示.

图2图2续1图2续2

2.1.4 KEGG通路富集分析

利用DAVID6.8.0数据库对81个靶点进行通路富集分析,得到281条信号通路(P<0.05),涉及癌症、乙型肝炎和TNF信号通路等,表明这些靶点可能主要通过调控这些通路达到干预疾病的目的.前20位信号通路气泡图如图3所示.

图3

2.1.5“成分—靶点—通路”网络构建及分析

将富集分析得到的排名前20的通路所对应的57个作用靶点及13种成分,运用Cytoscape3.7.1软件构建“成分—靶点—通路”网络,根据网络的拓扑学性质度值排序确定关键节点,在所构建的网络中,依据Degree值(度值)确定关键节点,度值>中位数(成分度值中位数=3,靶点度值中位数=15,通路度值中位数=14)的成分有4种,靶点有28个,通路有10条.4种成分为槲皮素、异鼠李素、β-谷甾醇及茵陈蒿灵A,度值分别为55、8、7和5,由于该4种化合物在网络中具有较高的连接度,提示这可能是茵陈发挥药效的主要活性成分.靶点的关键节点分别是AKT1、TNF、JUN、MAPK1、RELA、TP53及IL6,度值分别是38、37、37、36、36、34及31,表明这可能是茵陈化合物作用于癌症、肿瘤、乙肝与病毒等信号通路潜在的关键作用靶点.网络药理学研究从成分有效性角度提示槲皮素、异鼠李素、β-谷甾醇及茵陈蒿灵A等成分可作为茵陈潜在Q-marker进行深层次研究.

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